Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RhoP15409 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RhoP15409 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RhoP15409 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RhoP15409 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RhoP15409 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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