Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P10404 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms