Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm2056J3QQ02 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms