Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hdac5Q9Z2V6 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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