Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms