Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Rnf6Q9DBU5 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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