Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Med27Q9DB40 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms