Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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