Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms