Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccndbp1Q3TVC7 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms