Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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Usp39Q3TIX9 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Usp39Q3TIX9 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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