Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Siah1bQ06985 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms