Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RxraP28700 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxraP28700 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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