Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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PdgfraP26618 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PdgfraP26618 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PdgfraP26618 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PdgfraP26618 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PdgfraP26618 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PdgfraP26618 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PdgfraP26618 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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