Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Sptan1P16546 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sptan1P16546 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms