Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms