Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms