Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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