Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms