Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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Rabgef1Q9JM13 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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