Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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Rnft1Q9DCN7 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnft1Q9DCN7 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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