Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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