Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ubxn4Q8VCH8 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ubxn4Q8VCH8 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms