Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Nop53Q8BK35 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop53Q8BK35 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
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Nop53Q8BK35 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Nop53Q8BK35 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Nop53Q8BK35 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Nop53Q8BK35 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nop53Q8BK35 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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