Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms