Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Gm28047Q3US59 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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