Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp39Q3TIX9 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms