Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms