Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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