Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pabpc1P29341 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms