Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PtprmP28828 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PtprmP28828 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms