Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P10404 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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