Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Spta1P08032 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Spta1P08032 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms