Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rrn3B2RS91 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.7 ms