Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp29Q9ES63 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms