Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms