Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc47Q9D024 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms