Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Fam20bQ8VCS3 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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