Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms