Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm28047Q3US59 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm28047Q3US59 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms