Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Rnf149Q3U2C5 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Rnf149Q3U2C5 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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