Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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