Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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Pkp1P97350 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Pkp1P97350 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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