Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxc13P50207 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxc13P50207 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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