Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
VdrP48281 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
VdrP48281 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
VdrP48281 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
VdrP48281 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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