Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtbP41155 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms