Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Rpl28P41105 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms