Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Nedd1P33215 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms