Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RxraP28700 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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