Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
P10404 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P10404 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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